按照反應裝置的結構，自動生化分析儀主要分為流動式(Flow system)、分立式(Discrete system)兩大類。
1．流動式 指測定項目相同的各待測樣品與試劑混合后的化學反應在同一管道流動的過程中完成。這是第一代自動生化分析儀。
2．分立式 指各待測樣品與試劑混合后的化學反應都是在各自的反應杯中完成。其中有幾類分支。
(1)典型分立式自動生化分析儀。此型儀器應用最廣。
(2)離心式自動生化分析儀，每個待測樣品都是在離心力的作用下，在各自的反應槽內與試劑混合，完成化學反應并測定。由于混合，反應和檢測幾乎同時完成，它的分析效率較高。
3．袋式自動生化分析儀是以試劑袋來代替反應杯和比色杯，每個待測樣品在各自的試劑袋內反應并測定。
4．固相試劑自定生化分析儀(亦稱干化學式自動分析儀) 是將試劑固相于膠片或濾紙片等載體上，每個待測樣品滴加在相應試紙條上進行反應及測定。操作快捷、便于攜帶是它的優點。
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